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OVITO

OVITO  3.4.4 最新版

二維碼
  • 軟件授權(quán): 共享軟件
  • 軟件大?。? 63.53MB
  • 軟件評分:
  • 軟件類型: 國產(chǎn)軟件
  • 更新時(shí)間: 2024-12-30
  • 應(yīng)用平臺: win7及以上
  • 軟件語言: 簡體中文
  • 版      本: 3.4.4 最新版

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軟件介紹 相關(guān)專題 常見問題 下載地址

基本簡介
OVITO段首LOGO
OVITO最新版是一款專業(yè)實(shí)用的分子動力學(xué)模擬工具。OVITO官方版內(nèi)置了強(qiáng)大的分析功能,可以幫助用戶快速的進(jìn)行各種分子動力的模擬,為研究人員提供支持。OVITO軟件界面直觀,操作簡單,消耗內(nèi)存小,滿足用戶的各種分子運(yùn)動研究需求。
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版本說明
軟件地址

OVITO截圖

OVITO軟件介紹

      OVITO是一個(gè)針對原子和粒子模擬數(shù)據(jù)的科學(xué)可視化和分析軟件。它幫助科學(xué)家更好地了解材料現(xiàn)象和物理過程。該程序在開源許可下可在所有主要平臺免費(fèi)使用。作為分析、理解和說明仿真結(jié)果的有力工具,它已在越來越多的計(jì)算仿真研究中發(fā)揮作用。

OVITO軟件特色

      1. 消耗內(nèi)存小。相對于VESTA,VMD等軟件,消耗內(nèi)存小。導(dǎo)入大體系運(yùn)行流暢。

      2. 正則表達(dá)式。正則表達(dá)式功能使得OVITO對結(jié)構(gòu)的操作靈活自由。

      3. 豐富的內(nèi)置函數(shù)。豐富的內(nèi)置函數(shù)使其具有強(qiáng)大的分析功能。

OVITO使用教程

      【如何利用 OVITO找弗倫克爾缺陷】

      利用 OVITO 找弗倫克爾缺陷對需要準(zhǔn)備兩個(gè)文件:一個(gè)是結(jié)構(gòu)演化前的坐標(biāo)文件,一個(gè)是結(jié)構(gòu)演化過程的坐標(biāo)文件(這個(gè)是利用 LAMMPS 的 dump 命令進(jìn)行輸出)。以我上次最后給出的演化示意圖的制作為例,一共用到了 OVITO 的十個(gè)功能,我在下方圖中標(biāo)了出來。具體操作過程如下:

      將演化過程的文件導(dǎo)入 OVITO 軟件后,選取下圖2中標(biāo)注 1 處(Filecontains time series),告訴 OVITO 該文件是個(gè)演化過程文件,隨后選擇下圖中標(biāo)注 2 處(Add modification),這里面幾乎包含了 OVITO 軟件的所有功能,有興趣的同學(xué)可以去探索一下。在圖2 中標(biāo)注 2 處里面找到并選取 Wigner - Seitz defect analysis (這也是 NC 文章中所提到的缺陷分析方法);

OVITO截圖

      接著點(diǎn)擊下圖 標(biāo)注 5 處導(dǎo)入演化前的結(jié)構(gòu)文件。然后會在圖3 中標(biāo)注 6 處發(fā)現(xiàn)軟件告訴你找到幾個(gè)空位和幾個(gè)間隙子(一般情況下這兩個(gè)值是相等的),繼續(xù)點(diǎn)擊圖3 中標(biāo)注 7 處(播放鍵),OVITO 便會自動統(tǒng)計(jì)演化過程中每個(gè)時(shí)刻產(chǎn)生的空位數(shù)目和間隙子數(shù)目。

OVITO截圖

      但是,NC 文章中的演化圖中只有空位和間隙子,并不是 Fe 原子 ~,繼續(xù)選取 Add modification 處,找到里面的 Expression select(圖4 中標(biāo)注 8 處),選取后 OVITO 會給你一個(gè)方框,在里面填寫 Occupancy==1 (這是告訴 OVITO 讓它將沒有離開晶格位置的 Fe 原子都選中),然后在 2 處選擇 Delete selected particles(圖中標(biāo)注 9 處),讓 OVITO 將這些 Fe 原子都刪掉,這樣就只剩下空位和間隙子了,接著再次重復(fù)一下 Expression select 這個(gè)過程,選取 Occupancy == 2 或者 0 (這是告訴 OVITO 讓它將間隙子或者空位都選中),然后在 Add modification 中找到 Assign color(圖4中標(biāo)注 10 處),給選中的空位或者間隙子賦予自己喜歡的顏色,隨后再次點(diǎn)擊播放鍵,OVITO 將為你展示完整的缺陷演化過程。至于圖2 中標(biāo)注 3,4 這兩個(gè)地方,一個(gè)是輸出演化過程視頻文件,一個(gè)是輸出單張圖片。

OVITO截圖

      【如何利用 OVITO 做類似 NC 文章中的位錯環(huán)分析】

      由于本人重復(fù) NC 文章級聯(lián)碰撞過程使用的體系很小,所以根本形成不了位錯環(huán),因此很干脆的在 Fe 當(dāng)中手動的建了一個(gè)位錯環(huán),這里再給各位安利一個(gè)建模軟件,Atomsk,一款金屬材料界建模利器(多晶,晶界,位錯以及界面等等),有興趣的同學(xué)可以百度一下,以下是用 OVITO 展示了我用 Atomsk 建的一個(gè) Fe 的位錯環(huán)(導(dǎo)入坐標(biāo)文件后直接在 Add modification 中選取 Dislocation analysis(DXA)即可):

OVITO截圖

      可以看到 OVITO 不僅幫忙找出了位錯環(huán),而且還能幫忙指出了幾個(gè)位錯環(huán),各個(gè)位錯環(huán)的長度以及其伯格斯矢量(對應(yīng) NC 文章的 fig.3)。

OVITO更新日志

      1.修復(fù)BUG,新版體驗(yàn)更佳

      2.更改了部分頁面

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